MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw1 genomic sequence

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020274	GTG	2	6	12	17	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020274	TCA	2	6	25	30	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020274	GAA	2	6	85	90	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020274	A	6	6	98	103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020274	TTA	2	6	106	111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020274	TGA	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020274	ACAT	2	8	191	198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020274	GCA	2	6	318	323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020274	TTAAAC	2	12	346	357	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020274	AAGA	2	8	425	432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020274	TA	3	6	496	501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020274	CAT	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020274	AT	3	6	591	596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020274	T	6	6	612	617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020274	ATTTT	2	10	643	652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020274	ATT	2	6	678	683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020274	AATATA	2	12	689	700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020274	A	7	7	707	713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020274	TGCT	2	8	746	753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020274	TTA	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045534
21	NC_020274	TCC	2	6	874	879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020274	CTT	2	6	880	885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020274	AGC	2	6	890	895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020274	TGT	2	6	902	907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020274	GGT	2	6	961	966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020274	AG	3	6	995	1000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020274	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
28	NC_020274	TAAA	2	8	1041	1048	75 %	25 %	0 %	0 %	462045535
29	NC_020274	CGT	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	462045535
30	NC_020274	TTA	2	6	1076	1081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
31	NC_020274	T	7	7	1154	1160	0 %	100 %	0 %	0 %	462045535
32	NC_020274	TCT	2	6	1214	1219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045535
33	NC_020274	TAA	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
34	NC_020274	TTG	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	462045535
35	NC_020274	TAA	2	6	1267	1272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
36	NC_020274	TAA	2	6	1281	1286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
37	NC_020274	TTC	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045535
38	NC_020274	ATT	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
39	NC_020274	ATT	2	6	1414	1419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
40	NC_020274	ATC	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045535
41	NC_020274	T	6	6	1632	1637	0 %	100 %	0 %	0 %	462045535
42	NC_020274	TTA	2	6	1676	1681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
43	NC_020274	TTA	2	6	1685	1690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
44	NC_020274	T	7	7	1735	1741	0 %	100 %	0 %	0 %	462045535
45	NC_020274	AT	3	6	1773	1778	50 %	50 %	0 %	0 %	462045535
46	NC_020274	AT	4	8	1807	1814	50 %	50 %	0 %	0 %	462045535
47	NC_020274	ATC	2	6	1822	1827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045535
48	NC_020274	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
49	NC_020274	T	6	6	1903	1908	0 %	100 %	0 %	0 %	462045535
50	NC_020274	AAT	2	6	1925	1930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
51	NC_020274	CTTG	2	8	1958	1965	0 %	50 %	25 %	25 %	462045535
52	NC_020274	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
53	NC_020274	A	6	6	1993	1998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020274	TAA	2	6	2027	2032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020274	TTG	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020274	TA	3	6	2084	2089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020274	AT	3	6	2094	2099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020274	TTA	2	6	2130	2135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020274	AGT	2	6	2155	2160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020274	TAT	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020274	ATA	2	6	2184	2189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020274	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020274	GAT	2	6	2254	2259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020274	T	6	6	2282	2287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020274	ATTT	2	8	2329	2336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020274	GAA	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
67	NC_020274	TAA	2	6	2431	2436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
68	NC_020274	ATA	2	6	2472	2477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
69	NC_020274	TTCA	2	8	2479	2486	25 %	50 %	0 %	25 %	462045536
70	NC_020274	ATG	2	6	2493	2498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045536
71	NC_020274	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	462045536
72	NC_020274	ATA	2	6	2592	2597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
73	NC_020274	A	8	8	2597	2604	100 %	0 %	0 %	0 %	462045536
74	NC_020274	ATG	2	6	2616	2621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045536
75	NC_020274	AAT	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
76	NC_020274	ACT	2	6	2635	2640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045536
77	NC_020274	TAAA	2	8	2661	2668	75 %	25 %	0 %	0 %	462045536
78	NC_020274	CAA	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	462045536
79	NC_020274	TAA	2	6	2779	2784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
80	NC_020274	AGA	3	9	2812	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
81	NC_020274	ATT	2	6	2832	2837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045536
82	NC_020274	CGA	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	462045536
83	NC_020274	ATA	2	6	2856	2861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
84	NC_020274	AAG	2	6	2880	2885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
85	NC_020274	GAA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
86	NC_020274	ATCA	2	8	2912	2919	50 %	25 %	0 %	25 %	462045536
87	NC_020274	ACA	2	6	2920	2925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	462045536
88	NC_020274	CAAC	2	8	2936	2943	50 %	0 %	0 %	50 %	462045536
89	NC_020274	AAGAGA	2	12	2970	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
90	NC_020274	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
91	NC_020274	AAG	2	6	3012	3017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
92	NC_020274	GAA	2	6	3029	3034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
93	NC_020274	ATA	2	6	3054	3059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
94	NC_020274	AGG	2	6	3060	3065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	462045536
95	NC_020274	ACC	2	6	3070	3075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	462045536
96	NC_020274	A	6	6	3077	3082	100 %	0 %	0 %	0 %	462045536
97	NC_020274	TTC	2	6	3098	3103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045536
98	NC_020274	AATG	2	8	3114	3121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020274	ATC	2	6	3186	3191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020274	TAT	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020274	TAG	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020274	TATAA	2	10	3273	3282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020274	TAA	2	6	3286	3291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045537
104	NC_020274	TA	3	6	3329	3334	50 %	50 %	0 %	0 %	462045537
105	NC_020274	TCTT	2	8	3398	3405	0 %	75 %	0 %	25 %	462045537
106	NC_020274	GTTTAA	2	12	3473	3484	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	462045537
107	NC_020274	ATT	2	6	3493	3498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045537
108	NC_020274	TGC	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	462045537
109	NC_020274	ATGT	2	8	3632	3639	25 %	50 %	25 %	0 %	462045537
110	NC_020274	TCA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045537
111	NC_020274	TAA	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045537
112	NC_020274	T	6	6	3726	3731	0 %	100 %	0 %	0 %	462045537
113	NC_020274	TTC	2	6	3739	3744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045537
114	NC_020274	ATG	2	6	3798	3803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045537
115	NC_020274	AT	3	6	3836	3841	50 %	50 %	0 %	0 %	462045537
116	NC_020274	A	6	6	3885	3890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020274	ATG	2	6	3940	3945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045538
118	NC_020274	TA	3	6	4001	4006	50 %	50 %	0 %	0 %	462045538
119	NC_020274	TCTT	2	8	4070	4077	0 %	75 %	0 %	25 %	462045538
120	NC_020274	GTTTAA	2	12	4145	4156	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	462045538
121	NC_020274	TAA	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045538
122	NC_020274	ATGT	2	8	4304	4311	25 %	50 %	25 %	0 %	462045538
123	NC_020274	TCA	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045538
124	NC_020274	TAA	2	6	4390	4395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045538
125	NC_020274	T	6	6	4398	4403	0 %	100 %	0 %	0 %	462045538
126	NC_020274	TTC	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045538
127	NC_020274	ATG	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045538
128	NC_020274	AT	3	6	4508	4513	50 %	50 %	0 %	0 %	462045538
129	NC_020274	TAG	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045538
130	NC_020274	AGA	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020274	GAT	2	6	4659	4664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045539
132	NC_020274	AT	3	6	4663	4668	50 %	50 %	0 %	0 %	462045539
133	NC_020274	TGG	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	462045539
134	NC_020274	ATG	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045539
135	NC_020274	TA	3	6	4855	4860	50 %	50 %	0 %	0 %	462045539
136	NC_020274	AGA	2	6	4919	4924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045539
137	NC_020274	A	6	6	4929	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	462045539
138	NC_020274	TGG	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	462045539
139	NC_020274	ACG	2	6	5015	5020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	462045539
140	NC_020274	A	6	6	5256	5261	100 %	0 %	0 %	0 %	462045539
141	NC_020274	CA	3	6	5268	5273	50 %	0 %	0 %	50 %	462045539
142	NC_020274	CTA	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045540
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276	NC_020274	TAGA	2	8	11545	11552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
277	NC_020274	CAG	2	6	11637	11642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_020274	AGG	2	6	11687	11692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_020274	A	8	8	11748	11755	100 %	0 %	0 %	0 %	462045548
280	NC_020274	GAA	2	6	11830	11835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045548
281	NC_020274	CCG	2	6	11899	11904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	462045548
282	NC_020274	GCG	2	6	11917	11922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	462045548
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284	NC_020274	AAATC	2	10	12011	12020	60 %	20 %	0 %	20 %	462045548
285	NC_020274	A	7	7	12038	12044	100 %	0 %	0 %	0 %	462045548
286	NC_020274	GCA	2	6	12124	12129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	462045548
287	NC_020274	TCAAT	2	10	12163	12172	40 %	40 %	0 %	20 %	462045548
288	NC_020274	AGG	2	6	12183	12188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	462045548
289	NC_020274	AGA	3	9	12323	12331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020274	ATG	2	6	12346	12351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_020274	A	6	6	12390	12395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020274	A	7	7	12413	12419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_020274	ATG	2	6	12469	12474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045549
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303	NC_020274	AT	3	6	13037	13042	50 %	50 %	0 %	0 %	462045549
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305	NC_020274	AGA	2	6	13133	13138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.